上世纪六七十年代，中国科学技术遭遇了罕见的严冬。严东生也一度受到了很大影响，但他始终坚信并服从党的领导。在此期间，他还参与了领袖像的设计、建造、保护工程。面对艰苦的工作条件，他始终保持着对科学事业的忠诚与热情，不惧艰难，只要有一点可能，就坚持学习研究，与科研人员一起参与第一线的工作。对于自己曾经遭受的不公正待遇，他从未表现出怨气，而是默默地从事着组织上交给的工作。他的工资一度被克扣，每月仅能拿到15元。后来，工资额度得到了恢复，并于1972年一次性补全了以往所扣的工资。严东生将补发的工资外加一点存款，总共1万元人民币，全部交了党费，并没有留作家用开支。