1946年6月，年近40岁的倪达书远赴美国费城的宾夕法尼亚大学（以下简称宾大）动物系的David Henry Wenrich 教授实验室进修。Wenrich教授是王家楫先生1925—1928 年在美攻读博士期间的博士导师，是著名的原生动物学家，曾任美国原生动物学会主席，其研究涵盖了自由生活的原生动物、原生动物生理。当倪先生来到宾大时，接近退休阶段的Wenrich 教授正将研究兴趣集中于动物肠道原生动物的研究。于是，倪先生便在该实验室从事动物肠道鞭毛虫的研究。由于其出色的研究表现，当原定1 年的进修资助到期以后，倪先生又获得了美国哲学会提供的1 年期研究资助，至1948 年底回国。

倪先生非常珍惜此次进修机会，在宾大的2 年研修期间，潜心科研，发表学术论文3 篇，其中2 篇为单一作者文章，论文发表页数分别为42页和113 页，提供绘制的各类原生动物图像分别有87 幅和217 幅，其工作态度和严谨性，以及倪先生在那2 年间所付出的不懈努力，跃然纸上。绘图多达217 幅的这篇文章，针对常见的实验动物豚鼠（荷兰猪，Caviaporcella）肠道内原生动物开展了系统的形态学分类研究，共描述了4 个纲12 个科中的29 个物种，其中包括1 个新属和10 个新种。该论著对肠道中所能观察到的原生动物各生活史阶段进行了归纳和描述，对每个观察的物种及其可能的处于不同生活史阶段的对象，均配有形象的、多角度观察的手绘图版，为后人的研究提供直观认识。倪先生这篇发表于1950 年的文章，至今依然被研究肠道原生动物形态分类学工作者活跃地引用，尤其是有关肠道内原生动物的采集、固定和染色方法。

1948 年底，倪先生自美国进修返回上海的中央研究院动物研究所，继续受聘为研究员。接着他经历了拒迁台湾、护所迎接上海解放，以及中央研究院动物研究所改组为中国科学院水生生物研究所（以下简称水生所）等过程，倪先生继续受聘为水生所研究员。随着新形势的到来，服务工农及生产实践成为研究所需要强调的目标，倪先生曾希望利用他在美国新近获得的有关动物鞭毛虫的训练，在医学寄生虫学方面作些研究，以便结合工农需求，也因此对改组后的研究所放弃动物更为宽泛的学科，而隅于水体生物的方向感到迷惘。但他很快适应了学科调整，运用他的积累，开始了鱼类寄生虫的研究，建立了菱湖工作站，开创了我国的鱼病研究，以此将其研究与工农需求和生产实践相结合。